Le furet dégage une odeur musquée caractéristique. Ce parfum n'est pas forcément toléré par tout un chacun et peut même être qualifié de nauséabond par certains. Cette odeur provient essentiellement des glandes sébacées recouvrant son corps.
Ces glandes produisent un sébum qui sert entre autre chose à protéger la peau et le poil de l'animal. Il est faux de croire qu'un bain enlèvera l'odeur du furet, au contraire ! En nettoyant l'animal cela va inciter les glandes sébacées à sécréter davantage de sébum afin de remplacer la protection retirée lors du nettoyage.
Chaque furet a son odeur, une carte d'identité grâce à laquelle ses semblables pourront le reconnaître et se renseigner sur lui (son sexe, son état de reproduction...). Les furetons dégagent une odeur plus forte qui sert de répulsif face aux prédateurs. Les furets mâles émanent une senteur plus marquée que les femelles. Cela provient du fait qu'ils doivent protéger leur territoire contre d'autres mâles et sert d'attraction pour les furettes prêtes à l'accouplement. De plus lors du rut, ils marquent leur territoire avec leur urine très odorante. Celle-ci imbibant leur bas ventre augmente de surcroît leur odeur corporelle.
Le furet dispose de glandes anales. Ce sont des sacs situés de part et d'autre de l'anus. Ces glandes contiennent un liquide jaunâtre et malodorant que l'animal peut vider à volonté. Elles constituent un moyen de communication. Lors de grosses frayeurs par exemple le vidage de ses sacs constituera un moyen de défense. En cas de relâchement intense, de stress, de mécontentement ou douleur de l'animal ceux-ci peuvent également être vidés. L'odeur très forte provenant de ces glandes n'a aucune corrélation avec l'odeur corporelle habituelle du furet. Elle n'est qu'éphémère et donc une ablation de ces glandes n'atténuera en rien l'odeur musquée de l'animal. Il est à noter que l'ablation des glandes anales est considérée comme une mutilation par la convention européenne pour la protection des animaux de compagnie datée du 1er mai 2004, donc illégale (excepté raison médicale (tumeur, infection)).
Une bonne hygiène permettra d'atténuer l'odeur du furet. Un nettoyage régulier des endroits de repos (panier, hamac.) est recommandé. En effet le sébum sécrété par l'animal pénètre dans les tissus. L'animal se reposant dans ces derniers s'imprégnera du sébum contenu dans le tissus et la boucle sera bouclée ! La castration du mâle diminuera son odeur en stoppant le rut.
